Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms