Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ntf3P20181 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms