Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18530 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18530 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18530 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms