Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col3a1P08121 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms