Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spta1P08032 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Spta1P08032 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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