Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P04214 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P04214 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P04214 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P04214 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04214 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04214 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04214 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04214 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04214 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04214 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04214 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04214 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04214 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04214 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04214 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04214 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04214 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04214 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P04214 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P04214 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04214 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04214 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P04214 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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