Protein–RNA interactions for Protein: P01729

Ig lambda-2 chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01729 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01729 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01729 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01729 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01729 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01729 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01729 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01729 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms