Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms