Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stag2O35638 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stag2O35638 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stag2O35638 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stag2O35638 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stag2O35638 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stag2O35638 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stag2O35638 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stag2O35638 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Stag2O35638 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stag2O35638 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stag2O35638 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stag2O35638 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stag2O35638 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stag2O35638 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stag2O35638 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Stag2O35638 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stag2O35638 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Stag2O35638 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stag2O35638 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Stag2O35638 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Stag2O35638 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Stag2O35638 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stag2O35638 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stag2O35638 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stag2O35638 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Stag2O35638 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stag2O35638 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Stag2O35638 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms