Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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BC024978J3QPC3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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BC024978J3QPC3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
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BC024978J3QPC3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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BC024978J3QPC3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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BC024978J3QPC3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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BC024978J3QPC3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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BC024978J3QPC3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC024978J3QPC3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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