Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms