Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm6594J3QM43 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms