Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm21818J3KMS6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm21818J3KMS6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm21818J3KMS6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm21818J3KMS6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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