Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms