Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Vmn1r167G3UW71 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Vmn1r167G3UW71 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Vmn1r167G3UW71 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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