Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms