Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb9E9Q5G2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms