Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myo5cE9Q1F5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms