Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms