Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20521D3Z5F7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms