Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ube2d4D3YUH6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms