Protein–RNA interactions for Protein: B1AWC9

Pde4b, Phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4bB1AWC9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pde4bB1AWC9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pde4bB1AWC9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pde4bB1AWC9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Pde4bB1AWC9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Pde4bB1AWC9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Pde4bB1AWC9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Pde4bB1AWC9 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Pde4bB1AWC9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Pde4bB1AWC9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde4bB1AWC9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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