Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprsB0V2N1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms