Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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