Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm17190V9GX38 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm17190V9GX38 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm17190V9GX38 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm17190V9GX38 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm17190V9GX38 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm17190V9GX38 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm17190V9GX38 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm17190V9GX38 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm17190V9GX38 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm17190V9GX38 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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