Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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