Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip6Q9Z1Y4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip6Q9Z1Y4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms