Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M6

Rab9a, Ras-related protein Rab-9A, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab9aQ9R0M6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab9aQ9R0M6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab9aQ9R0M6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms