Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms