Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP6

Mkrn1, E3 ubiquitin-protein ligase makorin-1, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn1Q9QXP6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mkrn1Q9QXP6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mkrn1Q9QXP6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn1Q9QXP6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn1Q9QXP6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mkrn1Q9QXP6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn1Q9QXP6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn1Q9QXP6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mkrn1Q9QXP6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mkrn1Q9QXP6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mkrn1Q9QXP6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn1Q9QXP6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mkrn1Q9QXP6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mkrn1Q9QXP6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Mkrn1Q9QXP6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mkrn1Q9QXP6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn1Q9QXP6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn1Q9QXP6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn1Q9QXP6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn1Q9QXP6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn1Q9QXP6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn1Q9QXP6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn1Q9QXP6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn1Q9QXP6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Mkrn1Q9QXP6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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