Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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