Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms