Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pgpep1Q9ESW8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pgpep1Q9ESW8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pgpep1Q9ESW8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pgpep1Q9ESW8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pgpep1Q9ESW8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pgpep1Q9ESW8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pgpep1Q9ESW8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pgpep1Q9ESW8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pgpep1Q9ESW8 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pgpep1Q9ESW8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pgpep1Q9ESW8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pgpep1Q9ESW8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms