Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem27Q9ESG4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem27Q9ESG4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem27Q9ESG4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem27Q9ESG4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem27Q9ESG4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem27Q9ESG4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem27Q9ESG4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem27Q9ESG4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem27Q9ESG4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem27Q9ESG4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem27Q9ESG4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem27Q9ESG4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem27Q9ESG4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem27Q9ESG4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem27Q9ESG4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem27Q9ESG4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms