Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms