Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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