Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D4W2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9D4W2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms