Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ccdc47Q9D024 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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