Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Chmp3Q9CQ10 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Chmp3Q9CQ10 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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