Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms