Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54l2Q99NG0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54l2Q99NG0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54l2Q99NG0 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54l2Q99NG0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54l2Q99NG0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54l2Q99NG0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54l2Q99NG0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54l2Q99NG0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms