Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp11Q99K46 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms