Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Dicer1-201ENSMUST00000041987 9851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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SptssbQ925E8 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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