Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alpk3Q924C5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms