Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms