Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms