Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PpcsQ8VDG5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms