Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Uhrf1Q8VDF2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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