Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms