Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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